为进一步加强青海湖流域生态环境保护与综合治理工程生态监测体系建设，确保各项工作按计划完成。2012年10月16～17日，省水保局监测总站成立了由水保项目、工程技术人员及财务人员组成的项目检查组，对青海湖生态监测项目所涉及的海晏县、刚察县、天峻县的工程建设、资金使用及档案管理等工作进行了细致全面的检查。
检查组一行分别听取了组织实施单位相关人员的工作汇报，查阅了文档并仔细询问了项目进展情况，一致认为该工程建设较为规范，资料基本齐全，建设内容符合设计要求，同时检查组也针对存在的一些问题，提出了以下意见：
一、要求各组织实施单位严格遵照本项目资金管理办法，加强项目财务管理，合理安排资金使用，做到专人专账，账目清晰，单据规范。
二、进一步补充完善项目建设手续，对施工过程中存在的局部变更或与设计不符的其它调整，要做到有理有据，理由充分，程序合规。
三、加强项目资料的整理归档，完善项目建设各环节档案收集整理，争取档案工作与项目建设同步。
